Самые известные произведения — «Пылающий остров» и «Планета бурь». Последнее было экранизировано Павлом Клушанцевым в 1962 году под тем же названием. Этот фильм оказал значительное влияние на отечественную кинофантастику, право на его прокат приобрели 28 стран.

Казанцев проявлял большой интерес к парануачным и конспирологическим теориям. Опубликовал ряд статей, эссе и художественных произведений, в которых доказывал, что Тунгусский метеорит на самом деле являлся инопланетным кораблем, потерпевшим катастрофу в стратосфере Земли («Взрыв», «Гость из космоса», «Тунгусская катастрофа: 60 лет догадок и споров»), увлекался криптозоологией, «загадкой Атлантиды» и т. д. Выступал как последовательный противник курса, которым двинулась советская фантастика с начала 1960 годов, в прессе, внутренних рецензиях и официальных письмах в надзирающие инстанции критиковал А. и Б. Стругацких, А. Громову, К. Булычева, Л. и Е. Лукиных и др. В 1981 году награжден за вклад в фантастику премией «Аэлита» (Свердловск) вместе с Аркадием и Борисом Стругацкими.